Similar a otros esteroides. Hepatotóxico (oral e inyectable), tiene un efecto negativo sobre la próstata. Puede contribuir a la caída del cabello y al acné (acné). 

El fármaco inhibe ligeramente la producción de testosterona endógena y no conduce a la ginecomastia. En las mujeres, puede provocar una virilización grave. El wintrol también puede provocar hipertensión arterial, aumenta la cantidad de colesterol "malo" (que puede provocar una enfermedad coronaria). Según el fabricante de estanozolol (strombafort), su uso puede provocar depresión ovárica en mujeres, irregularidades menstruales e hipercalcemia. 

En los hombres: período prepuberal: síntomas de virilización, hiperpigmentación idiopática de la piel, disminución o cese del crecimiento (calcificación de las zonas de crecimiento de los huesos tubulares), en el período pospuberal: irritación de la vejiga, ginecomastia, priapismo; en la vejez: hipertrofia de próstata y / o carcinoma. 

Otros efectos secundarios según los datos del fabricante incluyen la progresión de la aterosclerosis, edema periférico, trastornos dispépticos, disfunción hepática con ictericia, cambios en el recuento de leucocitos, dolor en los huesos largos, hipocoagulación con tendencia a sangrar.

Un estudio de 1989 encontró que la ingestión oral de 6 mg de estanozolol por día por levantadores de pesas durante 6 semanas resultó en una disminución del 33% en los niveles sanguíneos de lipoproteínas de alta densidad ("colesterol bueno") y un aumento concomitante en las lipoproteínas de baja densidad ("malas" ) colesterol en un 29%.%; el aumento de peso en los que tomaron estanozolol fue aproximadamente el mismo que en los del estudio que tomaron 200 mg de enantato de testosterona por semana.